应用二代测序技术快速检测脑炎患者中的人类
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作者张毓洪坤邹月丽
通讯作者卜晖
年医院何俊瑛、卜晖教授团队在BMCVirologyJournal发表了应用二代测序技术快速检测脑炎患者中的人类疱疹病毒一文(IF:2.),探讨了二代测序技术在脑炎病因学诊断中的作用。
病例介绍
患者女性,47岁,主因反应迟钝3天,意识不清1天于年8月29日入院治疗。患者反应迟钝、左下肢颤抖、尿失禁3天,入院前1天突然发热,昏迷,医院住院治疗。脑MRI显示双侧扣带回和颞叶皮质FLAIR高信号病变(图1)。脑MRV显示正常。诊断为脑梗死,给予阿司匹林和阿托伐他汀钙治疗。
既往史:溃疡性结肠炎病史18年,口服激素(甲强龙,16mg/天)和异烟肼(0.3g/天)治疗。无吸烟、冠心病、糖尿病、高血压病史。
查体:昏迷(GCS3分),颈抵抗,无自主活动。
入院检查
血常规、生化、血沉未见异常。
脑脊液(CSF)开放压力为85mmH2O.
常规及生化检测结果:
蛋白0.55g/l(0.20-0.40);
白细胞1×/l(0.0-15.0);
葡萄糖3.2mmol/l(2.50-4.50);
氯.9mmol/l(-)。
异常脑脊液细胞学,可见35个淋巴细胞和1个单核细胞。
脑电图可见癫痫样异常放电和弥漫性慢波。
病情恶化
复查头CT显示与边缘脑炎相对应的双侧岛叶及额叶皮质的低密度病灶(图2)。
血清和脑脊液中自身免疫性脑炎和副肿瘤综合征相关检测均正常。
聚合酶链反应(PCR)检测CSF中单纯疱疹病毒1型和单纯疱疹病毒2型DNA均为阴性。
NGS助力诊断
NGS示HSV-1,特意序列数为条,占病毒读数的98.7%(图3a,b)。
明确诊断:单纯疱疹病毒性脑炎。给予静脉注射阿昔洛韦(mg,Tid)和膦甲酸钠(3g,Tid)治疗。
预后:经治疗后患者病情仍进行性加重,多次复查头CT示多发脑出血(图4,5),后家属放弃治疗,出院后患者死亡。
讨论
1.临床表现、影像学研究和脑脊液分析是诊断病毒性脑炎的基础。然而,目前使用传统的检测方法如PCR法很难识别病毒。
2.二代测序(NGS)是新的DNA测序技术,可同时对数百万级的DNA片段进行测序和分析,使用mNGS技术诊断中枢神经系统感染的新时代已被开启。
3.诊断病毒学是NGS最成功的应用之一,在发现和鉴定新病毒,检测临床标本中未预料到的病毒病原体方面已经取得了令人兴奋的结果。
4.随着NGS技术的日益普及,我们预计它将成为临床诊断的重要工具。
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